未取得《通知单》开红字专用发票怎样处理？

某公司于2008年8月20日销售货物一批，销售收入100万元，销项税额17万元。部分货物发出的同时，向购买方开具了增值税专用发票（按合同部分金额）。9月1日，购买方在收到货物和发票后，发现专用发票与合同金额不符，（因为合同没有执行完毕，为了提前要款，先部分开了发票），对方开具拒收证明，随即将“发票联、抵扣联”退还购买方，要求在合同执行完毕后重开。购买方在未取得税务机关出具的《开具红字增值税发票通知单》的情况下，擅自开具了红字专用发票（冲减销售收入100万元，冲减销项税额17万元）。10月1日合同基本执行完毕，经联系在没有改变原来开票金额的情况下，开具1份专用发票，另外多出的部分又开具1份发票。（销货方和购买方均为增值税一般纳税人） 综述销货方存在过错，没有执行国税发[2006]156号文件的规定，在未取得《开具红字增值税发票通知单》的情况下，擅自开具了红字专用发票，其行为违反了规定。但是，最终没有造成偷税或者少缴税款。之所以未取得通知单，是因为没有掌握文件规定。 请教：税务机关对销货方应作出怎样的处理？
根据《国家税务总局关于修订增值税专用发票使用规定的补充通知》（国税发[2007]18号）规定：（三）因开票有误购买方拒收专用发票的，销售方须在专用发票认证期限内向主管税务机关填报申请单，并在申请单上填写具体原因以及相对应蓝字专用发票的信息，同时提供由购买方出具的写明拒收理由、错误具体项目以及正确内容的书面材料，主管税务机关审核确认后出具通知单。销售方凭通知单开具红字专用发票。
根据《中华人民共和国发票管理办法》第三十六条规定， 违反发票管理法规的行为包括：
（ 一） 未按照规定印制发票或者生产发票防伪专用品的；
（ 二） 未按照规定领购发票的；
（ 三） 未按照规定开具发票的；
（ 四） 未按照规定取得发票的；
（ 五） 未按照规定保管发票的；
（ 六） 未按照规定接受税务机关检查的。
对有前款所列行为之一的单位和个人， 由税务机关责令限期改正， 没收非法所得，可以并处10000元以下的罚款。有前款所列两种或者两种以上行为的，可以分别处罚。
据此，贵单位在未取得《开具红字增值税专用发票申请单》的情况下就开具红字发票，违反了发票管理办法，同时贵单位违规开具的红字增值税专用发票不得抵减当期销项税额。

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