合伙人转让合伙企业份额，所得税怎么处理？

我国税法对合伙人转让合伙企业份额所得税征管没有统一规定，尤其对进行财产买卖的合伙人资产的计税基础，更是未明确规定。因此，各地区采用各不相同的征管方法，导致税负呈现地区性差异。
一、案例实况
中国自然人居民A，B，C于2010年1月5日在国内某市注册成立一家普通合伙企业ABC。成立当期的资产及负债情况如表1：
表1 资产表 单位：元
资 产
账面价值
市场公允价值
现 金
45000
45000
土 地
300000
405000
设 备
60000
90000
资产合计
405000
540000
合伙企业ABC简化资产、负债及所有者权益情况如表2：
表2 资产负债表 单位：元
资 产
调整后计税基础
市场公允价值
现 金
45000
45000
土 地
300000
600000
设 备
60000
120000
资产合计
405000
765000
金 额
市场公允价值
负 债
150000
150000
合伙人A
85000
205000
合伙人B
85000
205000
合伙人C
85000
205000
所有者权益合计
255000
615000
合 计
405000
765000
合伙企业的合伙人C以土地出资占合伙企业三分之一的份额，出资土地的账面价值为120000元，市场价值为180000元。2012年12月30日，C将其持有的份额转让给中国居民S，转让价格为255000元，S以现金付讫，同时承担C的合伙企合伙人转让合伙企业业债务的三分之一。转让行为发生后，合伙人C应如何纳税？
二、涉税争议
到目前为止对转让合伙企业份额的合伙人如何征税，我国税法没有明确规定。但在实践中有三种做法。
（一）对合伙人按照“财产转让所得”征收所得税，允许税前扣除财产原值和合理费用。即根据现行个人所得税政策，自然人合伙人转让投资资产按“财产转让所得”和20%的税率缴纳个人所得税。
（二）对合伙人按转让收入的一定比例核定征收所得税（仅适用于外地注册企业和账务不健全、无法查账征收的企业）。根据国家税务总局关于印发《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》的通知（财税[2000]91号）第七条规定：“企业依照国家有关规定应当设置但未设置账簿的；企业虽设置账簿，但账目混乱或者成本资料、收入凭证、费用凭证残缺不全难以查账的”，按照比例核定征收所得税。
（三）借鉴美国合伙企业法对合伙人征税方法征收个人所得税。借鉴美国税法对合伙人转让合伙企业份额时产生的所得或者损失的征税方法，将其视为转让资产的所得或损失，并对合伙人转让份额的计税基础进行调整。与第一种方法相比较，第三种方法避免了对留存收益重复征税。
对以上几种做法进行分析，首先应明确合伙人转让合伙企业份额所得的性质。该所得是转让合伙企业财产的所得还是合伙人转让个人财产的所得？合伙人转让合伙企业份额的计税基础是多少？
通过对各地征税方法的分析，上述三种征税方法均认为合伙人转让合伙企业份额是转让合伙企业财产而非个人财产，三种征税方法均按公允价值确认转让收益为255000元。但是，计算合伙人C转让合伙企业份额所得的资产计税基础如何确定呢？这个问题影响到应税所得的多少。
三、案例实况分析
我国对合伙人转让合伙企业份额的所得税征管还没有具体的规定，只能根据《中华人民共和国个人所得税法》、《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》（财税[2000]91号）、《财政部国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税[2008]159号）等法规，对合伙人转让合伙企业份额的所得税征管问题进行探讨。
《合伙企业法》对合伙人的计税基础没有强制规定，按合伙协议的规定，合伙人的计税基础分为四种情况：第一，以合伙人占合伙企业份额的账面价值作为合伙人的计税基础，即135000元；[1]第二，以出资时合伙人占合伙企业份额的公允价值作为合伙人的计税基础，即180000元；[2]第三，以合伙人出资资产的账面价值作为合伙人的计税基础，即120000元；第四，以合伙人出资资产的公允价值作为合伙人的计税基础，即180000元。
（一）国内相关法规分析
1.国家颁布的法规分析。
根据《国家税务总局关于个人终止投资经营收回款项征收个人所得税问题的公告》（国家税务总局公告2011年第41号）规定：“个人因各种原因终止投资、联营、经营合作等行为，从被投资企业或合作项目、被投资企业的其他投资者以及合作项目的经营合作人取得股权转让收入、违约金、补偿金、赔偿金及以其他名目收回的款项等，均属于个人所得税应税收入，应按照‘财产转让所得’项目适用的规定计算缴纳个人所得税。”
以上规定适用于个人终止投资经营的行为，但合伙人转让合伙企业份额并不是彻底终止投资，而是将其资本出售给新合伙人。因此，国税函[2011]41号文的规定是否适用于合伙人转让合伙企业份额的所得税征管问题值得考虑。再则如果以转让收入减去合伙人的初始投资（土地的原值），转让利得可能就隐含了合伙人留存于合伙企业的利润，且这部分利润已被课税，重复征税的情况又该如何解决？
依据国税函[2011]41号文合伙人C的个人所得税处理如下：
（1）以合伙人占合伙企业份额的账面价值作为合伙人的计税基础，即135000（元）。
应纳税所得额=255000-135000=12000（0元）
应纳税额=120000×20%=24000（元）
个人所得税的综合税负率=24000÷120000=20%
（2）以出资时合伙人占合伙企业份额的公允价值作为合伙人的计税基础，即180000（元）。
应纳税所得额=255000-180000=75000（元）
应纳税额=75000×20%=15000（元）
个人所得税的综合税负率=15000÷75000=20%
（3）以合伙人出资资产的账面价值作为合伙人的计税基础，即120000（元）。
应纳税所得额=255000-120000=13500（0元）
应纳税额=135000×20%=27000（元）
个人所得税的综合税负率=27000÷135000=20%
（4）以合伙人出资资产的公允价值作为合伙人的计税基础，即180000（元）。
应纳税所得额=255000-180000=75000（元）
应纳税额=75000×20%=15000（元）
个人所得税的综合税负率=15000÷75000=20%

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